Martin Berger wurde 1966 in Dohna (Sachsen) geboren.

Er studierte Physik in Jena. Dort gründete er Ende 1989 die Grüne Partei in der DDR mit. Dieses Engagement führte ihn nach dem Diplomabschluss 1991 auch beruflich in die Politik: Er arbeitete bis 1999 für die damalige Thüringer Landtagsfraktion und danach für den Landesverband von Bündnis 90 / Die Grünen. Seit 2000 ist er in verschiedenen Positionen für die Stadt Jena tätig, darunter  2005 bis Anfang 2013 als kaufmännischer Leiter des Eigenbetriebs Kommunale Immobilien Jena. 2010 erwarb er einen weiteren Hochschulabschluss als Wirtschaftsinformatiker. Seit 2013 ist er Leiter des Fachbereichs Finanzen der Jenaer Stadtverwaltung.

1997 bis 2003 war er ehrenamtlicher Vorstand der Heinrich-Böll-Stiftung Thüringen, seit 2015 arbeitet er in deren Aufsichtsrat mit. Ein weiteres großes ehrenamtliches Projekt ist für ihn die BürgerEnergie Jena eG, eine Genossenschaft mit heute über 800 Mitgliedern, die Mitgesellschafter der Jenaer Stadtwerke ist. Er gehörte 2011 zu den Mitgründern der Genossenschaft und war bis 2013 Vorstand, seitdem Aufsichtsratsmitglied.

Seine Interessen liegen vor allem in den Bereichen Wirtschaft, Haushalt und Finanzen, Bürgerbeteiligung sowie (naturwissenschaftliche) Bildung.